Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Nme3Q9WV85 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms