Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Psmb3Q9R1P1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms