Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr2e3Q9QXZ7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr2e3Q9QXZ7 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms