Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ChmQ9QXG2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChmQ9QXG2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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