Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Ldb3Q9JKS4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms