Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH4

Taf8, Transcription initiation factor TFIID subunit 8, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf8Q9EQH4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Taf8Q9EQH4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Taf8Q9EQH4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Taf8Q9EQH4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Taf8Q9EQH4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms