Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SrpraQ9DBG7 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms