Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pdzd9Q9D9M4 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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