Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Chmp4cQ9D7F7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms