Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PrameQ9D4Z5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrameQ9D4Z5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms