Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pabpc6Q9D4E6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pabpc6Q9D4E6 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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