Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trappc6bQ9D289 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trappc6bQ9D289 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms