Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Spns3Q9D232 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms