Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Elp3Q9CZX0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms