Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ChtopQ9CY57 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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