Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ddx28Q9CWT6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ddx28Q9CWT6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ddx28Q9CWT6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ddx28Q9CWT6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ddx28Q9CWT6 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ddx28Q9CWT6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ddx28Q9CWT6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ddx28Q9CWT6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ddx28Q9CWT6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ddx28Q9CWT6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ddx28Q9CWT6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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