Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Chchd5Q9CQP3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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