Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms