Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms