Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Chmp3Q9CQ10 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Chmp3Q9CQ10 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Chmp3Q9CQ10 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Chmp3Q9CQ10 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Chmp3Q9CQ10 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Chmp3Q9CQ10 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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