Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW0

Cntnap2, Contactin-associated protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap2Q9CPW0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cntnap2Q9CPW0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cntnap2Q9CPW0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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