Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Vmp1Q99KU0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Vmp1Q99KU0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Vmp1Q99KU0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Vmp1Q99KU0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Vmp1Q99KU0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Vmp1Q99KU0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vmp1Q99KU0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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