Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Myh10-201ENSMUST00000018887 7667 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Slit2-208ENSMUST00000173107 9960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Hcfc1-201ENSMUST00000033761 8138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Hist1h1d-201ENSMUST00000045301 7425 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Wdfy3-201ENSMUST00000053177 14274 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Myo6-201ENSMUST00000035889 7871 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
SptssbQ925E8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms