Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Stx18Q8VDS8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Stx18Q8VDS8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms