Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms