Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3A2

Trpt1, tRNA 2'-phosphotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpt1Q8K3A2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trpt1Q8K3A2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trpt1Q8K3A2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms