Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ClasrpQ8CFC7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms