Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms