Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Usp27Q8CEG8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
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Usp27Q8CEG8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Usp27Q8CEG8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Usp27Q8CEG8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp27Q8CEG8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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