Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tsr2Q8C8T8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tsr2Q8C8T8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms