Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp38Q8BW70 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp38Q8BW70 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp38Q8BW70 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Usp38Q8BW70 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Usp38Q8BW70 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Usp38Q8BW70 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Usp38Q8BW70 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Usp38Q8BW70 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp38Q8BW70 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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