Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp397Q7TNK4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms