Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp8b3Q6UQ17 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms