Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Arhgap20Q6IFT4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Arhgap20Q6IFT4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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Arhgap20Q6IFT4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Arhgap20Q6IFT4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Arhgap20Q6IFT4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Arhgap20Q6IFT4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Arhgap20Q6IFT4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Arhgap20Q6IFT4 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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