Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scaf8Q6DID3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms