Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3rf1Q69ZI1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3rf1Q69ZI1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms