Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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PtprdQ64487 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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PtprdQ64487 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PtprdQ64487 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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PtprdQ64487 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PtprdQ64487 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PtprdQ64487 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtprdQ64487 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprdQ64487 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms