Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

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Length 441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pacsin1Q61644 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Pacsin1Q61644 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Pacsin1Q61644 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pacsin1Q61644 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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