Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a3Q5XF89 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp13a3Q5XF89 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms