Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Tsr1Q5SWD9 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Tsr1Q5SWD9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Tsr1Q5SWD9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Tsr1Q5SWD9 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Tsr1Q5SWD9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Tsr1Q5SWD9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Tsr1Q5SWD9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Tsr1Q5SWD9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Tsr1Q5SWD9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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