Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Spire1Q52KF3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Spire1Q52KF3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Spire1Q52KF3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spire1Q52KF3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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