Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Xirp2Q4U4S6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms