Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHU5

Mtcl1, Microtubule cross-linking factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtcl1Q3UHU5 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtcl1Q3UHU5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms