Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx27Q3UHD6 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Snx27Q3UHD6 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx27Q3UHD6 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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