Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cops9Q3U898 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms