Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc13Q3TIR1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc13Q3TIR1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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