Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cpne9Q1RLL3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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