Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rundc1Q0VDN7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms