Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ttc21bQ0HA38 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms