Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cnn1Q08091 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cnn1Q08091 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms